pockets of excellence - участки (очаги, места) совершенства.
Я бы перевел описательно, смысл следующий:
В разных структурных единицах организации достигнуто совершенство рабочих процессов на отдельных участках при отсутствии системного механизма или платформы для распространения возникающих возможностей