Все правильно вам говорят. Издательство сообщает размер тиража и цену одного экземпляра. Баланс - это вот это все минус аванс, т.е. остаток причитающейся автору суммы.
Только, по-моему, не отчет через 90 дней, а выплата остатка (цена на количество минус аванс) в течение 90 дней. Тогда все совсем логично.